O Instituto Jacaré tem como principal objetivo o monitoramento e manejo das populações naturais de jacarés de papo amarelo (Caiman latirostris) no Estado do Rio de Janeiro, e tem como seu principal projeto de pesquisa o Projeto Jacaré.
O Projeto Jacaré já atua em diversas áreas do estado incluindo a bacia hidrografica de Jacarepaguá, no municipio do Rio de Janeiro; a Reserva Ecologica de Guapiaçú (REGUA) em Cachoeira de Macacu e atualmente com intuito de iniciar a pesquisa na APA de Guapimirim, Guapimirim-RJ. e na ESEC da Guanabara.O interesse na criação do Instituto Jacaré partiu da iniciativa de arrecadar fundos para a pesquisa e desenvolvimento dos estudos com jacarés de papo amarelo se extendendo a comtemplar a deficiencia no manejo de fauna silvestre e a carência de especialistas de campo para atuar nas populações naturais da fauna no Estado do Rio de Janeiro.
